Marquinho foi um dos oito jogadores dispensados pelo Fluminense no fim de 2017, em tentativa do clube de reduzir a folha salarial para a temporada 2018. Destes atletas, seis fizeram acordo com o Tricolor e cinco já entraram na Justiça após falta de pagamento.
No começo do ano, o Tricolor celebrou com o meia um acordo de rescisão no valor de R$ 6 milhões, referentes a verbas trabalhistas atrasadas (salário, férias, 13º), parcelas não recolhidas de FGTS e verbas rescisórias. Os pagamentos seriam divididos em uma parcela de R$ 1 milhão, outra de R$ 2,6 milhões e 20 de R$ 120 mil.
A primeira parcela foi paga corretamente no vencimento de 28/02/2018. A segunda, vencida em 30/4/2018, está atrasada, assim como as primeiras de R$ 120 mil. O jogador entrou na Justiça em 10 de agosto após o descumprimento do acordo. No combinado, em caso de atraso, estavam previstos multa de 10% sobre o saldo devedor e juros de 1% ao mês.
